Les poissons migrateurs représentent dans le Sud Ouest de la France des enjeux patrimoniaux, économiques et sociaux de premier rang.

Leur préservation s’appuie sur des plans de gestion par « Bassin Versant ».
Les mesures concernent l’évaluation des populations, la restauration des stocks, la gestion durable de la pêche, la réduction des impacts sur les milieux.

La préservation des poissons migrateurs amphihaiins est une priorité.

Le Decret_94-157_940216_version_consolidee_au_070322 :

s’applique aux cours d’eau et aux canaux affluant à la mer, tant en amont de la limite de salure des eaux que dans leurs parties comprises entre cette limite et les limites transversales de la mer, à leurs affluents et sous-affluents ainsi qu’aux plans d’eau avec lesquels ils communiquent, dans la mesure où s’y trouvent des poissons migrateurs appartenant aux espèces suivantes :

• saumon atlantique (Salmo salar) ;
• grande alose (Alosa alosa) ;
• alose feinte (Alosa fallax) ;
• lamproie marine (Petromyzon marinus) ;
• lamproie fluviatile (Lampetra fluviatilis) ;
• anguille (Anguilla anguilla) ;
• truite de mer (Salmo trutta, f. trutta).

 Une gestion concertée Créés en 1994 et présidés par le préfet de la région Aquitaine, deux Comités de Gestion des Poissons Migrateurs  (COGEPOMI) couvrent l’ensemble du territoire du bassin Adour-Garonne.

•  Le comité de gestion des poissons migrateurs du bassin de l’Adour (COGEPOMI Adour) couvre les cours d’eau des bassins de l’Adour et des cours d’eau côtiers dont l’embouchure est située dans les départements des Landes et des Pyrénées-Atlantiques, à l’exclusion de la Bidassoa.
• La  Diren Aquitaine assure le secrétariat de ces comités chargés d’élaborer et de suivre des plans de gestion quinquennaux. L’ensemble des acteurs concernés (Administrations, collectivités territoriales, établissements publics, associations, usagers, etc.) est associé à l’élaboration de ces plans et contribue à leur mise en œuvre.

 Évaluation et suivi des populations pour adapter les stratégies de gestion
Des réseaux de suivi des populations sont mis en œuvre. Ils rendent compte de l’état et de l’évolution des stocks (comptages au niveau des passes à poissons, statistiques de pêche, pêche d’inventaire, etc.)

 Mesures de gestion Des mesures de gestion sont proposées visant :

• à conserver ou améliorer les conditions de reproduction, de développement, de circulation,
• à restaurer les stocks lorsque cela est nécessaire (saumon, esturgeon), par des opérations de production et de déversements d’Alevins,
• à concilier le maintien des populations sur le long terme et les exigences des activités halieutiques.

Les rivières concernées sont classées en application de

dont la liste a été reprise et éventuellement complétée par le SDAGE (schéma directeur d’aménagement et de gestion des eaux)   Adour Garonne .